Každý bojovník musí bežať rýchlo a pre ninju je to predpoklad a to vôbec neznamená, že rýchlo utečie z bojiska. Hrdina hry Nano Ninjas uteká pred nebezpečným predátorom, ktorý ho prenasleduje. Roky tréningu mu umožnia dlhý beh a vy mu pomôžete obratne prekonávať prekážky.